遅すぎる pandas.read_gbq を使わずに、Google BigQueryの公式クライアントを利用して高速にデータを読み込む

pandas.read_gbq 便利ですよね。

クレデンシャルファイルを認証画面からコピペすれば Jupyter Notebook 上で簡単に認証され、Google BigQuery が実行されてその結果がそのままデータフレームとして扱えます。

Jupyter Notebook と Google BigQuery を連携させたいときは愛用していました(過去形)。

問題点

• そこそこ大きなデータを持ってこようとすると、めちゃくちゃ遅くてストレスが凄い

解決方法として、Google BigQuery で巨大なデータをダウンロードする方法について書きます。

実は Google の公式ドキュメントでも推奨されています。

• https://cloud.google.com/bigquery/docs/pandas-gbq-migration

• https://cloud.google.com/bigquery/docs/bigquery-storage-python-pandas

方法は以下の２つ。

1. google-cloud-bigquery をインストールして、マジックコマンドで Google BQ を実行

2. BQ 実行 →BigQuery table として保存 →GCS へ保存 → gsutil でマシンへコピー

1 番目は、Jupyter 上でマジックコマンドで Google BQ が実行できて、速度も pandas.rad_gbq よりも高速です

2 番目はそもそも実行結果が巨大な場合で、目安としては1GB以上なら 2 番目の方法を使えば楽です。

1, google-cloud-bigquery をインストールして、Jupyter Notebook のマジックコマンドで Google BQ を実行

 
pip install --upgrade google-cloud-bigquery[bqstorage,pandas]
 

magic command を実行

 
%load_ext google.cloud.bigquery
 

後は Jupyter Notebook のセルで以下のコマンドを実行すれば、

%%bigquery df --use_bqstorage_api
SELECT
  CONCAT(
    'https://stackoverflow.com/questions/',
    CAST(id as STRING)) as url,
  view_count
FROM `bigquery-public-data.stackoverflow.posts_questions`
WHERE tags like '%google-bigquery%'
ORDER BY view_count DESC
LIMIT 10

df にマジックコマンドで実行した SQL の実行結果が格納されます!

便利ですね

2, BQ 実行 →BigQuery table として保存 →GCS へ保存 → gsutil でマシンへコピー

• BigQuery でクエリを実行、実行結果を BigQuery Table へ保存

• 注)実行結果の容量が巨大なので、保存先は基本的に Big Query Table へ保存するしか選択肢が無い

• BigQuery table から GCS へテーブルを CSV として保存

Big Query table からエクスポート時に、ファイルサイズが大きいとエクスポートできないので、分割が必要です。

https://cloud.google.com/bigquery/docs/exporting-data

保存ファイル名を file-* のようにワイルドカードを指定すると、自動的にひとつのテーブルを複数ファイルに分割して保存してくれる

gsutil commands で任意のマシンへダウンロードする。

-m オプションを付け足すと並列ダウンロードが始まるので、複数ファイルダウンロードする場合はおすすめです

ストレスレスなデータ分析ライフを!